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明末，人们迷信修仙炼丹拒绝求医，中医式微。少年医者李子明机缘巧合之下从一本破旧的《本草纲目》中召唤出药灵——冬葵仙子。她恳请世间唯一能和曾经的李时珍一样与药灵对话的李子明帮助药灵们收集因事故四散的《本草纲目》残页，拯救草药精灵们的世界，同时将《本草纲目》中记载的资料流传下来，将中医发扬光大。李子明医者仁心，不忍拒绝，从此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不断成长，收集残页的同时也与药灵们结下深厚羁绊。

人生中曾一起相聚的同路人，所发生的小故事。

由于人族的贪婪，其他种族逐渐在一次次的混战中隐匿了痕迹——混战中水中界被纳入地上界版图，除了精灵族，现在地上界的情况是这样的：异族在人族中只剩下了传说和教会的宣传口号，但是除了精灵族外的其他种族其实在地上界还各有活动，只是隐藏了真实身份。拉法尔，来自天上界的精灵，由于不可告人的秘密来到人间界，遇见各色各样的人类，并与其中三个伙伴组成团队一起粉碎邪恶的阴谋。